Ingénieur système informatique (H/F)

Manpower BREST TERTIAIRE recherche pour son client, basé à Plouzané, un Ingénieur bio-informatique (H/F)
Rattaché(e) au chef du service de bio-informatique (SeBiMER), vous rejoignez une équipe dynamique pour renforcer ses activités de développement et de gestion de données.
Vos missions :
En collaboration avec les équipes de biologistes d'Ifremer, vous serez chargé(e) de :
- Améliorer le protocole interne de gestion de données bioinformatiques egide-athENA (Python, Nextflow).
- Contribuer à la gestion FAIR des données bioinformatiques de l'institut
- Participer au support bioinformatique général auprès des équipes de recherche
- Développer et maintenir egide (Python) : correction de bugs, nouvelles fonctionnalités, gestion de métadonnées selon les standards EN
- Développer et maintenir athENA (Nextflow) : validation et publication de métadonnées à l'ENA
- Assurer la gestion FAIR des données : récupération des données de séquençage, organisation sur DATARMOR, validation et soumission des métadonnées, suivi via athENA-manager
- Accompagner les équipes de recherche : support technique et rédaction de documentation
Formation : Bac5 en bioinformatique ou informatique
Compétences techniques :
- Python (indispensable) et librairies associées (openpyxl, pysam, pyfastx, pandas, numpy).
- Bash et connaissance de Nextflow
- Git/GitLab et outils de collaboration
- Environnement Unix/Linux et clusters de calcul
- Bon niveau d'anglais technique
Qualités personnelles :
- Organisation, autonomie, sens du service
- Aisance relationnelle et travail en équipe
- Excellentes capacités de communication écrite (français et anglais)

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